1、研发费用核算不清、辅助账不完整、不规范或暂未建立。需按《工作指引》相关要求编制研发费用辅助账，归集研发费用。
2、研发费用真实性存疑，研发费大于管理费或占比过高。
3、研发费归集不合理，如研发人员人员年均费用远低于一般人员水平，直接投入占研发费总额的比例过高，不同研发项目支出金额、结构完全一样。4、委托外部研发的支出全额计入研发费，未按80%计入研发费。
5、研发费用中其他费用占比超过20%。
6、研发费用明细表和研发项目（RD）表不一致。
7、委托外部研发支出与附件材料产学研合作协议所列不一致，如某研发项目为产学研合作项目，但该项目研发结构明细表中无委托外部研发支出。
8、研发项目无证明材料，项目立项报告千篇一律，临时拼凑。
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